17年前の羽田浩司のダイイングメッセージをひも解いたコナン。   コナンの推理では、 ASACA　=　RUM   と判断されたが、   その後、 父親の工藤優作と赤井秀一の推理では、 CARASUMA　（カラスマ） が正しいメッセージだと解読され、   組織のボスは 烏丸蓮耶である！ ということが明らかになった。

  APTX4869（アポトキシン4869） コナン（新一）や灰原哀（宮野志保）がこれを飲んで幼児化してしまった薬。   作中では灰原の手によりアポトキシン4869の解毒剤が作られ、 コナンがそれを使い新一の姿に戻ってはまた幼児化してしまったりと、 現時点では一時的に元の姿に戻れる「試作品」の段階である。